Toxina botulinică s-a dovedit eficientă în tratarea hiperhidrozei, adică a transpirației excesive, a axilelor, mâinilor și picioarelor. În lunile calde problema devine mai vizibilă, mai ales la axile, unde petele inestetice pot crea jenă la serviciu și în viața socială. Când sunt afectate mâinile, oamenii evită adesea să dea mâna, ceea ce poate afecta relațiile.
La persoanele cu această problemă, transpirația crește adesea stresul, iar stresul crește transpirația. Toxina botulinică poate rezolva problema prin microinjecții în zonele afectate. La axile nu este nevoie de anestezie, tratamentul fiind practic nedureros; pentru mâini și picioare este necesar un bloc al principalilor nervi senzitivi. Tratamentul se face în cabinet.
Cele mai bune rezultate se obțin la axile: de obicei, la 24–48 de ore după injecții, transpirația scade treptat până aproape dispare. Tratamentul mâinilor și picioarelor dă și el rezultate foarte bune.
Beneficiul este temporar, de obicei 6–8 luni pentru axile, cu variații individuale, iar tratamentul se poate repeta când transpirația revine. Contraindicațiile sunt aceleași ca pentru utilizarea estetică a toxinei botulinice: boli neurologice grave și intoleranță sau alergie la componente. Complicațiile sunt practic absente, cu excepția unei posibile scăderi temporare a forței mâinii, care se rezolvă spontan. Acest tratament costă de obicei mai mult decât cel estetic, deoarece necesită o cantitate mult mai mare de toxină.