肉毒素已被证明能有效治疗多汗症，即腋下、手掌和足部出汗过多。在炎热的月份，问题更加明显，尤其是腋下，难看的汗渍会在工作和社交中带来尴尬。手部多汗的人常常回避握手，可能影响人际关系。
对有这种困扰的人来说，出汗往往加重紧张，而紧张又会加重出汗。肉毒素通过在相关部位进行微量注射来解决这个问题。腋下无需麻醉，治疗几乎无痛；手部和足部则需要对主要感觉神经进行阻滞麻醉。治疗在诊所进行。
腋下效果最好：通常在注射后 24–48 小时内，出汗逐渐减少，直至几乎消失。手部和足部的治疗效果也非常令人满意。
效果是暂时的，腋下通常维持 6–8 个月，因人而异，出汗恢复时可重复治疗。禁忌症与美容用途相同：严重的神经系统疾病以及对成分不耐受或过敏。并发症几乎没有，只是手部力量可能暂时减弱，会自行恢复。这项治疗通常比美容治疗费用更高，因为所需的肉毒素量大得多。