Botulinumtoksin har vist seg effektivt ved behandling av hyperhidrose, altså overdreven svetting i armhuler, hender og føtter. I varme perioder blir problemet mer synlig, særlig i armhulene, der skjemmende svetteflekker kan skape forlegenhet på jobb og sosialt. Når hendene er rammet, unngår man ofte å håndhilse, noe som kan skade relasjoner.
Hos dem med dette problemet øker svettingen ofte stresset, og stresset øker igjen svettingen. Botulinumtoksin kan bryte denne sirkelen med mikroinjeksjoner i de berørte områdene. I armhulene trengs ingen bedøvelse, fordi behandlingen er nesten smertefri; på hender og føtter trengs en blokade av de viktigste følelsesnervene. Behandlingen gjøres på klinikken.
De beste resultatene oppnås i armhulene: vanligvis avtar svettingen gradvis 24 til 48 timer etter injeksjonene til den nesten er borte. Også behandling av hender og føtter gir svært tilfredsstillende resultater.
Effekten er midlertidig, i armhulene vanligvis 6–8 måneder, med individuelle forskjeller, og behandlingen kan gjentas når svettingen kommer tilbake. Kontraindikasjonene er de samme som ved estetisk bruk: alvorlige nevrologiske sykdommer og overfølsomhet eller allergi mot innholdsstoffene. Komplikasjoner forekommer praktisk talt ikke, bortsett fra en mulig forbigående svekkelse av kraften i hånden, som går over av seg selv. Behandlingen koster vanligvis mer enn den estetiske, fordi det trengs mye mer toksin.